შინაგან საქმეთა სამინისტროს ინფორმაციით, მომხდარზე გამოძიება სისხლის სამართლის კოდექსის 115-ე მუხლით დაიწყო, რაც თვითმკვლელობამდე მიყვანას გულისხმობს.
ქრისტეფორე წამალაიძის თქმით, მისი შვილი ჯანმრთელობის პრობლემებს არ უჩიოდა. გარდაცვალების მიზეზის დასადგენად ცხედარს ექსპერტიზა უტარდება.
სასულიერო სემინარიის სტუდენტებმა 1988 წელს ქრისტეფორე წამალაიძეს გაუგზავნეს წერილი, სადაც ისინი სემინარიის მაშინდელ რექტორს, ამჟამად წილკნისა და დუშეთის მიტროპოლიტს, ზოსიმეს სექსუალურ შევიწროებაში ადანაშაულებდნენ. გუშინ გამართულ პრესკონფერენციაზე მეუფე ზოსიმემ თქვა, რომ ამ სტუდენტების უკან ქრისტეფორე წამალაიძე იდგა. სასულიერო პირების მხილება საპატრიარქოში განვითარებულ მოვლენებს მოჰყვა. 31 ოქტომბერს გამართულ სინოდის სხდომაზე ჭყონდიდის ეპარქიის მმართველი პეტრე ცაავა გადააყენეს და მღვდელმოქმედება აუკრძალეს. მეუფე პეტრემ თქვა, რომ „სინოდს ჰყავს პიდარასტიის, მამათმავლური ცოდვით შეპყრობილი თავმჯდომარე“.
სინოდის თავმჯდომარე სრულიად საქართველოს კათოლიკოს-პატრიარქი ილია მეორეა.